1. 国家重点研发计划、2017YFC0906801、临床样本中代谢组的探针增敏及超灵敏定量检测分析技术（子课题） 201707-201912、320万、主持

2. 国家自然科学基金重点项目、21635006、基于质谱探针技术的模型鼠粪便代谢物全分析方法学研究 201701-202112、290万元、主持

3. 国家自然科学基金重大研究计划集成项目、91217309、多种植物激素的同时检测方法学研究 201301-2015/12、300万元、主持

4. 国家自然科学基金重大研究计划重点项目、91017013、植物激素的超微量检测及原位探测方法研究、2011/01-2014/12、240万元、主持。

5. 国家自然科学基金面上项目、31070327、稳定同位素标记技术在植物激素相对定量及植物遗传学研究中的应用、2011/01-2013/12、36万元、主持。

6. 国家重点基础研究发展计划（973 计划）、2012CB720601、基于核酸的重大疾病诊断新策略和新技术研究、2012/01-2016/08、60万元、参与。

7. 国家重点基础研究发展计划（973 计划）、2013CB910702、翻译后修饰对蛋白质功能的影响、2013/01-2017/08、91万元、在研、参与。

8. 国家重点基础研究发展计划（973 计划）子课题、2007CB914200、受体诱导的低丰度磷酸化蛋白的富集技术及分析、2007/08-2011/12、185万元、参与。

9. 国家科技支撑计划项目子课题、2006BAF07B03、固相微萃取材料制备关键技术研究、2007/01-2009/12、35万元、主持。

10. 国家自然科学基金杰出青年基金、20625516、液相色谱、2007/01-2009/12、200万元、主持。

11. 国家自然科学基金委重大研究计划培育项目、90717101、拟南芥及近缘种中植物激素高通量、超微量定量和原位检测技术及其用于抗病机理研究、2008/01-2009/12、60万元、主持。

12. 国家自然科学基金面上项目、20475040、新型蛋白质分离介质的研究、2005/01-2007/12、23万元、主持。

13. 国家自然科学基金面上项目、31670373、植物内源性多胺的LC-MS分析方法研究、2017/01-2020/12、65万元、主持。

14. 国家自然科学基金面上项目、21475098、基于稳定同位素标记的LC-MS方法及其在食品组学中的应用、2015/01-2018/12、85万元、主持。

15. 教育部新世纪优秀人才支持计划、编号：NCET-05-0614、管内固相微萃取－液相分离联用技术研究、2006/01-2008/12、50万元、已结题、主持。